Changes between Version 1 and Version 2 of openEHR Models, Archetypes and Biomedical Ontologies
- Timestamp:
- Aug 5, 2007, 1:01:47 AM (17 years ago)
Legend:
- Unmodified
- Added
- Removed
- Modified
-
openEHR Models, Archetypes and Biomedical Ontologies
v1 v2 10 10 * 本ページの目的 11 11 * 背景 12 oオントロジーとは何か? そして何故それが大切なのか?13 oオントロジーは情報分野において果して意味があるか?14 o経緯12 * オントロジーとは何か? そして何故それが大切なのか? 13 * オントロジーは情報分野において果して意味があるか? 14 * 経緯 15 15 * 成功を判断する基準 16 16 * 医学生物学オントロジー 17 17 * openEHRのどの部分がオントロジーと関係するか? 18 oopenEHR参照モデル19 oopenEHRアーキタイプ20 oopenEHRにおける語彙18 * openEHR参照モデル 19 * openEHRアーキタイプ 20 * openEHRにおける語彙 21 21 * 参照 22 22 23 23 * Purpose of this page 24 24 * Background 25 oWhat are Ontologies and why do we care?26 oDo Ontologies make sense for Information?27 oSome History25 * What are Ontologies and why do we care? 26 * Do Ontologies make sense for Information? 27 * Some History 28 28 * Success Criteria 29 29 * Biomedical Ontologies 30 30 * What parts of openEHR have Ontological Relevance? 31 oThe openEHR Reference Model32 oThe openEHR Archetypes33 oTerminologies and openEHR31 * The openEHR Reference Model 32 * The openEHR Archetypes 33 * Terminologies and openEHR 34 34 * References 35 35 … … 67 67 68 68 世界中でオントロジーに対する作業が進行しており、それは医学生物学分野も例外ではない。その多くは事実(この場合は記録された患者データ)に基づいた推論を可能にするのを目的としている。オントロジーによってモデル化を果そうとする多く試みのひとつは、オントロジーを用いて推論をするための材料となるデータそのものをオントロジーによって意味付けることである。実際には、データの情報モデルがオントロジーと整合性を保たなければならないことを意味している。換言すれば、ある患者がある「アレルギー」を持つというデータがあれば、このデータはオントロジーにおける「アレルギー」と同一の意味を持つということである。しかしながら、語句がしばしばうまく定義できないという理由から、実際にはこのようにうまくはいかない。すなわち、「アレルギー」は「アレルギー反応」という意味でも使われるし、また「診断名としてのアレルギー」という意味でも用いられるからである。 69 69 70 There is much work going on in ontologies around the world, including in biomedical ontologies. Most of the work is designed with computer-based reasoning on facts e.g. recorded in patient data in mind. One of the challenges of ontological models is that to work, the data on which inferencing is to be done using the ontology must themselves have a meaning consistent with the ontology. In practical terms this means that the information model(s) of the data must be consistent with the ontologies, in other words, if the data record a 'allergy' for a patient, this has the same meaning as 'allergy' does in the ontology. However, this is often not the case due to poorly defined terms; 'allergy' might have been used to mean 'an allergic reaction' or 'a diagnosed allergy. 70 71 … … 99 100 100 101 * 記録されたものの実体はどのような型を持つか(すなわち、それはメモであるか、何らかの結果であるか、それとも診断名であろうか) 101 * 記録された情報はどのような構造を持つか? 例えば出産のような出来事は明らかに様々な 102 Clearly quite different recordings could be made of the same event in reality, such as a childbirth 103 * what are the relationships between items of information? Relationships such as 'see also', 'more detail' and so on make sense here, but not between the entities in reality being reported on. 102 * 記録された情報はどのような構造を持つか? 例えば出産のような出来事は明らかに様々な構造を持ちうる。 103 * 情報の項目は互いにどのような関係を持つであろうか? この文書では「ここも参照」とか「詳細はこちら」などは意味が通じるだろうが、現実に報告された情報においてはそうではないだろう。 104 104 105 105 * what types of recorded entities are there (e.g. notes, results, diagnoses) … … 107 107 * what are the relationships between items of information? Relationships such as 'see also', 'more detail' and so on make sense here, but not between the entities in reality being reported on. 108 108 109 openEHRでは、これらオントロジーのいずれもが我々の関心の対象となる。電子カルテシステムは記録された情報を扱うものであるから、情報に関するオントロジーは重要である。しかしながら、記録された情報においては我々は無論以下の事柄が記述されていることを期待する。 110 109 111 In openEHR we are interested in ontologies of both kinds. Since the EHR is about recorded information, ontologies of information are relavent. However, within recorded information of course we expect to find: 112 113 * 報告された現象に関する構造と意味。例えば、腹部の診察に関する記録は、少なくとも何らかの解剖学的な用語と特徴が記載されるだろうし、それらは我々の持つ解剖学的知見に反してはならず、したがって、解剖学のオントロジーのような医学生物学分野の実体に関するオントロジーと矛盾してはならない。 114 * 例えばICDコードやSNOMED用語など、基本的なオントロジーから抽出された概念への参照 110 115 111 116 * structuring and semantics that are in some way related to the phenomena being reported on. E.g. a record of an abdominal examination is likely to include at least some anatomical terms and characterisations, which should not violate what we know of anatomy, and therefore, should be compatible with ontologies of biomedical reality such as an anatomy ontology. 112 117 * references to concepts from ontologies of the first kind, e.g. ICDx or SNOMED terms. 113 118 119 そこで基本的なオントロジーは大変重要となる。我々はまだそれらがどのように相互に関連するかについてはよく理解してはいないが。 120 114 121 Ontologies of the first kind are therefore just as important. In our opinion, it is not yet clear how they inter-relate.... 115 122 [top] 123 経緯 116 124 Some History 125 現時点では、我々はまだ医療情報分野におけるオントロジーについて包括的な概観を提供するつもりはない。しかしながら、最近数年のあいだになされたオントロジーに関する重要な成果をここで言及することは意味がある。 117 126 118 127 At the moment we are not trying to provide a comprehensive summary of the work done in the area of health information ontologies, but it is worth mentioning some of the work of ontological significance that has occurred over the years: 119 128 120 129 * Theoretical approaches 121 o1968: Weed's POMR defined a problem/SOAP model of clinical information [ref]122 o1978: Elstein described a hypothetico-deductive model of clinical reasoning (mainly diagnosis) [ref]123 o1992: Rector, Nowlan and Kay described an approach in which EHR information included (paraphrasing) 'what can be said, thought and done for the patient' [ref]124 o1994: GEHR (Good European Health Record) an EU-funded project that developed requirements for an EHR and an information model [ref]125 o2003: Tange et al proposed a synthesis of the POMR, Elstein and 'conversation for action;' theory [ref]130 * 1968: Weed's POMR defined a problem/SOAP model of clinical information [ref] 131 * 1978: Elstein described a hypothetico-deductive model of clinical reasoning (mainly diagnosis) [ref] 132 * 1992: Rector, Nowlan and Kay described an approach in which EHR information included (paraphrasing) 'what can be said, thought and done for the patient' [ref] 133 * 1994: GEHR (Good European Health Record) an EU-funded project that developed requirements for an EHR and an information model [ref] 134 * 2003: Tange et al proposed a synthesis of the POMR, Elstein and 'conversation for action;' theory [ref] 126 135 * Practical approaches: 127 136 o 1998- : the Danish G-EPJ ('EPJ' = 'EHR'), which described a cycle very similar to the one used in openEHR [ref]
